温婉酒窝

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3年0月9天

linux gzip 多线程,多线程gzip压缩神器—pigz

Fastq文件为纯文本文件,占用的硬盘空间较大,所以一般都会将Fastq文件压缩成gz格式,很多软件也支持fastq的gz格式输入。我用过python读取gzip,非常方便。单纯的通过gzip的命令压缩fastq,效率非常非常慢,据说是没有利用整个机器的cpu。于是我就找到了pigz这款神器,可以在压缩数据时,发挥多核多处理器的优势,简而言之就是利用多线程进行gzip任务,比单纯的gzip压缩要快...