生物信息常用30个Linux命令（一）

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我是靠谱客的博主震动大碗，最近开发中收集的这篇文章主要介绍生物信息常用30个Linux命令（一），觉得挺不错的，现在分享给大家，希望可以做个参考。

概述

学习生物信息，Linux是必须掌握的内容，其实常用的Linux命令也就30个左右，而且这些命令都是单词的简写，记忆起来并不困难。从这次内容开始，我们将详细介绍这30个左右的命令。
1、cd
cd：Change directory
修改工作目录，cd和ls应该是使用最多的两个命令，尤其是对于Linux目录结构不熟的用户。

cd / #进入根目录
cd - #返回上次的目录
cd #返回home目录
cd ~ #返回home目录
cd …/ # 返回上一级目录
2、ls
ls：List files

-a 列出包括.a开头的隐藏文件的所有文件
-A 通-a，但不列出".“和”…"
-l 列出文件的详细信息
-c 根据ctime排序显示
-t 根据文件修改时间排序
—color[=WHEN] 用色彩辨别文件类型 WHEN 可以是’never’、'always’或’auto’其中之一
3、pwd
print working directory

$pwd
/home/wangtong
4、sh
script
运行脚本的命令，脚本是包含很多命令的一个文件，sh 这个文件，就可以之和运行，例如目录下有个多个sh文件，就可以一次运行。

$ sh a1.index.sh;
sh a2.fasqc.sh
5、cp
cp: Copy file
拷贝并粘贴文件
-b 覆盖前做备份
-f 如存