【scRNAtoolVis】单细胞分析基本图形的美化

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我是靠谱客的博主忐忑小蝴蝶，这篇文章主要介绍【scRNAtoolVis】单细胞分析基本图形的美化，现在分享给大家，希望可以做个参考。

scRNAtoolVis由laojunjun开发，个人感觉是对单细胞分析中前几个基本图形的美化，但是仍然需要对成图做一定细节修改，主要是ggplot2 ecosystem.

Chapter 7 jjDotPlot | The documentation of scRNAtoolVis package

featurecorneraxes和clustercorneraxes这两个函数主要是解决多个marker平行展示中，将umap坐标系缩小、统一，同时有加框等操作。

个人觉得最有用的是markervocano与ggvocano函数，主要是解决多cluster marker如何展示的问题。主要有两种展示方式：1，图形化展示，前阵子比较火的就是duggle vocano plot。就是这种形式：

复制代码

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markerVocalno(markers = markers,
              topn = 5,
              labelCol = ggsci::pal_npg()(9))

复制代码

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#这种图其实提供的有用信息不多，而且比较冗杂，见仁见智

jjVolcano(diffData = pbmc.mar

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