概述
介绍
一般来说,我们做生存分析,会有(P<0.05)和(P>0.05)两种结果。KM plot在生物医学中很常见,主要用来做预后分析,比如可以根据表达量把病人分成两组,然后比较哪组病人预后好,进而可以得出基因表达量高低与病人预后好坏相关性的结论。
画KM plot时,有时候会比较纠结怎样对病人进行分组,如何来设置分组的cutoff。一般来说常见的几种设置cutoff值得思路如下:
1:大多数情况下,根据表达量从低到高对样本进行排序,取前50%为低表达,后50%为高表达,然后画KM plot。
2:还有一些文章也会将样本表达量均分为三组或者四组。
3:一些文章也会选一些其它的cutoff,比如前1/3和后2/3,前25%和后25%(中间50%的数据去掉)。
例子
例如下面例子所示:(通过NFE2L2基因的表达量中位值,我们将所有的样本分为高表达和低表达两组,然后通过绘制KM生存分析曲线的形式来探讨两组生存概率是否存在差别)
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最后
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