海洋生物数据集

1、创建海洋生物数据集

#1、创建数据集
import numpy as np
import pandas as pd
def createDataSet():
    row_data = {'no surfacing':[1,1,1,0,0],
    'flippers':[1,1,0,1,1],
    'fish':['yes','yes','no','no','no']}
    dataSet = pd.DataFrame(row_data)
    return dataSet

dataSet = createDataSet()
dataSet

2、计算香农熵

"""
函数功能：计算香农熵  值越小，则不纯度就越低
参数说明：
dataSet：原始数据集
返回：
ent:香农熵的值
"""
def calEnt(dataSet):
    n = dataSet.shape[0]                      #数据集总行数
    iset = dataSet.iloc[:,-1].value_counts() #标签的所有类别
    p = iset/n                               #每一类标签所占比
    ent = (-p*np.log2(p)).sum()              #计算信息熵
    return ent

3、数据集最佳切分函数

划分数据集的最大准则是选择最大信息增益，也就是信息下降最快的方向。

# 3、数据集最佳切分函数
# 划分数据集的最大准则是选择最大信息增益，也就是信息下降最快的方向。
"""
函数功能：根据信息增益选择出最佳数据集切分的列
参数说明：
dataSet：原始数据集
返回：
axis:数据集最佳切分列的索引
"""
#选择最优的列进行切分
def bestSplit(dataSet):
    baseEnt = calEnt(dataSet)  #计算原始熵
    bestGain = 0               #初始化信息增益
    axis = -1                  #初始化最佳切分列，标签列
    
    for i in range(dataSet.shape[1]-1):                   #对特征的每一列进行循环
        levels= dataSet.iloc[:,i].value_counts().index     #提取出当前列的所有取值
        ents = 0                                           #初始化子节点的信息熵
    
        for j in levels: #对当前列的每一个取值进行循环
            childSet = dataSet[dataSet.iloc[:,i]==j]             #某一个子节点的dataframe
            ent = calEnt(childSet)                                #计算某一个子节点的信息熵
            ents += (childSet.shape[0]/dataSet.shape[0])*ent      #计算当前列的信息熵
#         print(f'第{i}列的信息熵为{ents}')
        infoGain = baseEnt-ents                                   #计算当前列的信息增益
#         print(f'第{i}列的信息增益为{infoGain}')
        if (infoGain > bestGain):
            bestGain = infoGain                                    #选择最大信息增益
            axis = i                                               #最大信息增益所在列的索引
    return axis

4. 按照给定列切分数据集

# 4. 按照给定列切分数据集
"""
函数功能：按照给定的列划分数据集
参数说明：
    dataSet：原始数据集
    axis：指定的列索引
    value：指定的属性值
返回：
    redataSet：按照指定列索引和属性值切分后的数据集
"""
def mySplit(dataSet,axis,value):
    col = dataSet.columns[axis]
    redataSet = dataSet.loc[dataSet[col]==value,:].drop(col,axis=1)
    return redataSet

5、递归构建决策树

# 5、递归构建决策树
"""
函数功能：基于最大信息增益切分数据集，递归构建决策树
参数说明：
dataSet：原始数据集（最后一列是标签）
返回：
myTree：字典形式的树
"""
def createTree(dataSet):
    featlist = list(dataSet.columns) #提取出数据集所有的列
    classlist = dataSet.iloc[:,-1].value_counts() #获取最后一列类标签
    #判断最多标签数目是否等于数据集行数，或者数据集是否只有一列
    if classlist[0]==dataSet.shape[0] or dataSet.shape[1] == 1:
        return classlist.index[0]            #如果是，返回类标签
    axis = bestSplit(dataSet)                  #确定出当前最佳切分列的索引
    bestfeat = featlist[axis]               #获取该索引对应的特征
    myTree = {bestfeat:{}}                  #采用字典嵌套的方式存储树信息
    del featlist[axis]                     #删除当前特征
    valuelist = set(dataSet.iloc[:,axis])  #提取最佳切分列所有属性值
    
    for value in valuelist:                #对每一个属性值递归建树
        myTree[bestfeat][value] = createTree(mySplit(dataSet,axis,value))
    return myTree

6、决策树的存储和读取

# 6、决策树的存储和读取
#树的存储
np.save('myTree.npy',myTree)
#树的读取
read_myTree = np.load('myTree.npy').item()
read_myTree

7、使用SKlearn中graphviz包实现决策树的绘制

# 7、使用SKlearn中graphviz包实现决策树的绘制

#导入相应的包
from sklearn import tree
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
import graphviz
#特征
Xtrain = dataSet.iloc[:,:-1]
#标签
Ytrain = dataSet.iloc[:,-1]
labels = Ytrain.unique().tolist()
Ytrain = Ytrain.apply(lambda x: labels.index(x)) #将本文转换为数字
#绘制树模型
clf = DecisionTreeClassifier()
clf = clf.fit(Xtrain, Ytrain)
tree.export_graphviz(clf)
dot_data = tree.export_graphviz(clf, out_file=None)
graphviz.Source(dot_data)

#给图形增加标签和颜色
dot_data = tree.export_graphviz(clf, out_file=None,
                                     feature_names=['no surfacing', 'flippers'],
                                     class_names=['fish', 'not fish'],
                                     filled=True, rounded=True,
                                     special_characters=True)
graphviz.Source(dot_data)

#利用render方法生成图形
# graph = graphviz.Source(dot_data)
# graph.render("fish")

8、根据决策树进行预测

# 8、根据决策树进行预测
"""
函数功能：对一个测试实例进行分类
参数说明：
inputTree：已经生成的决策树
labels：存储选择的最优特征标签
testVec：测试数据列表，顺序对应原数据集
返回：
classLabel：分类结果
"""
def classify(inputTree,labels, testVec):
    firstStr = next(iter(inputTree)) #获取决策树第一个节点
    secondDict = inputTree[firstStr] #下一个字典
    featIndex = labels.index(firstStr) #第一个节点所在列的索引
    for key in secondDict.keys():
        if testVec[featIndex] == key:
            if type(secondDict[key]) == dict :
                classLabel = classify(secondDict[key], labels, testVec)
            else:
                classLabel = secondDict[key]
    return classLabel

"""
函数功能：对测试集进行预测，并返回预测后的结果
参数说明：
train：训练集
test：测试集
返回：
test：预测好分类的测试集
"""
def acc_classify(train,test):
    inputTree = createTree(train) #根据测试集生成一棵树
    labels = list(train.columns) #数据集所有的列名称
    result = []
    for i in range(test.shape[0]): #对测试集中每一条数据进行循环
        testVec = test.iloc[i,:-1] #测试集中的一个实例
        classLabel = classify(inputTree,labels,testVec) #预测该实例的分类
        result.append(classLabel) #将分类结果追加到result列表中
    test['predict']=result #将预测结果追加到测试集最后一列
    acc = (test.iloc[:,-1]==test.iloc[:,-2]).mean() #计算准确率
    print(f'模型预测准确率为{acc}')
    return test

train = dataSet
test = dataSet.iloc[:3,:]
acc_classify(train,test)

最后

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