默认情况下，我们是对Seurat中的RNA的Assay进行操作。最初开始的数据只有一个RNA的assay，数据在进行变换SCT，或者整合单样本数据intergration，或去除污染SoupX，或融合velocity；都会将处理后的结果数据存放到新的Assay中。可以通过查看当前默认的assay，通过更改当前的默认assay。counts为raw原始数据，我们开始对assay中的RNA数据中的counts进行处理，对稀疏矩阵进行归一化处理后的结果存储在data， 接着用ScaleData()处理
R
2024-06-08
44 点赞
0 评论
66 浏览
