温柔洋葱

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2年10月17天

minfi:甲基化芯片数据分析

1.Introductionminfi包适用于分析450K和850K的甲基化矩阵。每个样本在一个矩阵上以两个不同的颜色通道(red、green)进行测量;每个矩阵测量4.5E5个CpG,对每个CpG的甲基化和未甲基化进行度量。样品之间的DNA甲基化差异可以在单个CpG处,称为差异甲基化位置(DMP),也可以在区域水平上,称为差异甲基化区域(DMR)。2.minfi object(1) R...

IDEA创建maven 一直loading archetype list

在这种情况下,强行点下一步创建项目后,会出现下面的情况:解决方法:Setting---->Build Tools → Maven → Importing, setVM options for importerto-Xmx1024m(默认的是-Xmx512m)之前有修改过这个参数,当时的设置是Xms1024m。关于Xms、Xmx:-Xms最小堆的大小,也就...

CodeForces - 645C Enduring Exodus(二分)

题目链接:http://codeforces.com/problemset/problem/645/C题意:给你n个房间, 0代表空房子, 1代表非空的房子, 一个农夫和他的k个牛要住进空房子里面,i房子和j房子的距离是|j-i| 问农夫约翰和他的最远的牛的最小值是多少?思路:这一题是求最大值的最小值,是一道很明显的二分的题。所以,我们可以枚举每一个空的房间,二分找出农夫住这个房间时与他最远的...

nyoj746整数划分(四)【区间dp】

整数划分(四)时间限制:1000 ms  |            内存限制:65535 KB难度:3描述       暑假来了,hrdv 又要留学校在参加ACM集训了,集训的生活非常Happy(ps:你懂得),可是他最近遇到了一个难题,让他百思不得其解,他非常郁闷。。亲爱的你能帮帮他吗?      问题是我们经常见到的整数划分,给出两个整数 n , m ,要求在

elasticsearch-hadoop使用记录

elasticsearch-hadoop是一个深度集成Hadoop和ElasticSearch的项目,也是ES官方来维护的一个子项目,通过实现Hadoop和ES之间的输入输出,可以在Hadoop里面对ES集群的数据进行读取和写入,充分发挥Map-Reduce并行处理的优势,为Hadoop数据带来实时搜索的可能。 项目网址:http://www.elasticsearch.org/overvie

窗口函数--配合over(...)的选项 rows/range between ... preceding and ... following--工作备忘2016/9/30

说明:在使用over()函数进行统计(尤其是求和,求平均的等)的时候,有时候需要设定一个范围(时间,数值等),因此,oracle提供了窗口函数选项rows/rang between ... preceding and ... following 分析函数的语法结构一般是:分析函数名(参数) OVER (PARTITION BY子句 ORDER BY子句 ROWS/RANGE子句