minfi:甲基化芯片数据分析
1.Introductionminfi包适用于分析450K和850K的甲基化矩阵。每个样本在一个矩阵上以两个不同的颜色通道(red、green)进行测量;每个矩阵测量4.5E5个CpG,对每个CpG的甲基化和未甲基化进行度量。样品之间的DNA甲基化差异可以在单个CpG处,称为差异甲基化位置(DMP),也可以在区域水平上,称为差异甲基化区域(DMR)。2.minfi object(1) R...