UMAP分析及可视化
什么是UMAP？和PCA一样，一种降维的算法，如果不是统计学或者数据专业的人，我建议不要去看它的原理，知道如何用就足够了。也许听到UMAP最多的是对单细胞数据的分析降维，类似于下图：然而其他数据，像大样本的转录组在PCA降维效果不好的时候，可以使用UMAP，毕竟现在转录非常便宜，随便测几十个样品和玩似的。首先构建一个数据集，行为样本，列为基因，并对样本的特征进行分组。读入数据：setwd("E:/生物信息学")options(stringsAsFactors= F)#...
