单细胞UMAP降维图的修饰(一些偏僻问题)
本来呢,单细胞UMAP或者TSNE降维图正常展示就好了,最多修改颜色坐标就可以,但是奈何总是有文章挑战别人的眼睛,非要秀一波非常规操作,那我们也只能把他们打下神坛。事情的起因是看了这篇文章中的UMAP图,有啥特点呢?每个点都是有边框的,这不就是ggplot中选择shape=21的形状吗?很显然,Dimplot是实现不了的。UMAP降维图本质也是散点图,只需要将作图数据导出,ggplot2就可以实现任何你想要的修饰了。首先我们设置下颜色,并将作图的数据导出,导出的数据包含UMAP两个坐标的数据。