合适黑夜

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3年1月10天

单细胞基础分析 | 基因细胞类型特异性富集分析

本文目标是:通过分析单细胞的数据,根据已有的细胞分型,去看我们感兴趣的基因集在这些细胞类型中的富集情况。单细胞数据和bulk数据会有些不同,可能一些具体的技巧需要注意一下。1。切换到R4环境,加载RDS数据。conda activate r4R #进入到Rdata<-readRDS("merge_obj.rds") # 加载原始数据library(Seurat)#加载Seurat包levels(data) #查看数据集的level [1] "L5 IT