支持向量机多分类代码python_scikitlearn支持向量机分类的多类数据输入处理

60 阅读 0 评论 40 点赞

我是靠谱客的博主愉快项链，最近开发中收集的这篇文章主要介绍支持向量机多分类代码python_scikitlearn支持向量机分类的多类数据输入处理，觉得挺不错的，现在分享给大家，希望可以做个参考。

概述

我尝试创建一个基于支持向量机的分类器(使用scikit learn)，输入如下：

多个蛋白质序列，单个序列中每个位置有4种状态(如下图所示)：>sequence_1

EISLNGYGRFGLQYVEDRGVGLEDTIISSRLRINIVGTTETDQGVTFGAKLRMQWDDGDAFAGTAGNAAQFWTSYNGVTVSVGNVDTAFDSVALTYDSEMGYEASSFGDAQSSFFAYNSKYDASGALDNYNGIAVTYSISGVNLYLSYVDPDQTVDSSLVTEEFGIAADWSNDMISLAAAYTTDAGGIVDNDIAFVGAAYKFNDAGTVGLNWYDNGLSTAGDQVTLYGNYAFGATTVRAYVSDIDRAGADTAYGIGADYQFAEGVKVSGSVQSGFANETVADVGVRFDF

>topology/feature

iLPLPLPLPLPLPoooooooooooooLPLPLPLPLPLPLiiiiiLPLPLPLPLPLPLoooooPLLPPPLPLPLPLiiLPLPLPooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooPLPLPLPLPLiiLPLPLPLPooooooooooooooLPLPLPLPiiiLPLPLPLPoooooooooooLPLPLPLPLiiiPPLPLPLPoooooooooPLPLPLPLPLiiLPLPLPLPoooooooooPLPLPLPLPiiiiLPLPLPLPoooooooPLPLPLPLPi

>sequence_2

MNKYSYCATMIAAILSTTTMANASSLAISVANDDAGIFQPSLNALYGHPAADRGDYTAGLFLGYSHDLTDASQLSFHIAQDIYSPSGANKRKPEAVKGDRAFSAFLHTGLEWNSLATNWLRYRLGTDIGVIGPDAGGQEVQNRAHRIIGAEKYPAWQDQIENRYGYTAKGMVSLTPAIDIL