概述
决策树可视化
- 说明
- 可视化结果
说明
- 决策树相关内容,详情可见 决策树算法
Graphviz是一个开源的图(Graph)可视化软件,采用抽象的图和网络来表示结构化的信息。在数据科学领域,Graphviz的一个用途就是实现决策树可视化。为了将决策树可视化,首先需要创建一个dot文件来描述决策树,使用Graphviz将dot文件转换为图形文件,如png、jpg等。
- 安装graphviz库
详细安装过程,可参考Graphviz安装及使用-决策树可视化
pip install graphviz
或者用conda安装graphviz
conda install python-graphviz
通过export_graphviz()方法生成dot_data,此时的dot_data是一个字符串类型的数据
tree.export_graphviz(clf,
out_file="tree.dot",
feature_names = fn,
class_names=cn,
filled = True)
可以使用scikit-learn的tree.plot_tree方法来利用matplotlib将决策树可视化
tree.plot_tree(clf);
可视化结果
代码如下(示例):
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn import tree
import graphviz
# Graphviz是一个开源的图(Graph)可视化软件,采用抽象的图和网络来表示结构化的信息
# 决策树可视化方法
# 加载数据集
data = load_iris()
# 转换成.DataFrame形式
df = pd.DataFrame(data.data, columns = data.feature_names)
# 添加品种列
df['Species'] = data.target
# 用数值替代品种名作为标签
target = np.unique(data.target)
target_names = np.unique(data.target_names)
targets = dict(zip(target, target_names))
df['Species'] = df['Species'].replace(targets)
# 提取数据和标签
X = df.drop(columns="Species")
y = df["Species"]
feature_names = X.columns
labels = y.unique()
X_train, test_x, y_train, test_lab = train_test_split(X,y,
test_size = 0.4,
random_state = 42)
model = DecisionTreeClassifier(max_depth =3, random_state = 42)
model.fit(X_train, y_train)
# 1. 以文字形式输出树
text_representation = tree.export_text(model)
print(text_representation)
# 2. 用图片画出
# 使用scikit-learn的tree.plot_tree方法来利用matplotlib将决策树可视化
plt.figure(figsize=(30,10), facecolor ='g') #
a = tree.plot_tree(model,
feature_names = feature_names,
class_names = labels,
rounded = True,
filled = True,
fontsize=14)
plt.show()
# 3. 使用Graphviz得到的决策树可视化
# 将决策树模型导出为dot文件
# DOT data
dot_data = tree.export_graphviz(model, out_file=None,
feature_names=data.feature_names,
class_names=data.target_names,
filled=True)
# Draw graph
graph = graphviz.Source(dot_data, format="png")
graph.render('DecisionTree')
最后
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