化学结构格式SDF的认识

68 阅读 0 评论 45 点赞

我是靠谱客的博主现代月亮，最近开发中收集的这篇文章主要介绍化学结构格式SDF的认识，觉得挺不错的，现在分享给大家，希望可以做个参考。

概述

第一行：一般作为分子名字，如 Levetiracetam

第二行：注释，ChemDraw06111413562D

第三行：一般是空行

第四行：是原子个数键的个数等的起始行。

M END所在行结束原子个数键的个数等信息。

属性1

属性1值

空行

属性2

属性2值

空行

(以四个美元符号结束一个分子的信息存储。)

Levetiracetam
  ChemDraw06111413562D

 12 12  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
   -1.4405   -0.4285    0.0000 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.7260   -0.8410    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.0116   -0.4285    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    0.7029   -0.8410    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    1.4174   -0.4285    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.0116    0.3965    0.0000 N   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.7260   -1.6660    0.0000 N   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    0.6559    0.8814    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    0.4009    1.6660    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.4241    1.6660    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.6790    0.8814    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    1.4405    0.6265    0.0000 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  1  2  2  0      
  2  3  1  0      
  3  4  1  1      
  4  5  1  0      
  3  6  1  0      
  2  7  1  0      
  6  8  1  0      
  8  9  1  0      
  9 10  1  0      
 10 11  1  0      
 11  6  1  0      
  8 12  2  0      
M  END
>  <Catalog Number> (1)
A1198

>  <Item Name> (1)
Levetiracetam

>  <Formula> (1)
C8H14N2O2

>  <MolWeight> (1)
170.21

>  <CAS Number> (1)
102767-28-2

>  <Target> (1)
Cancer Biology

$$$$

参考

http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=950202&do=blog&quickforward=1&id=855096