我是靠谱客的博主 甜甜黄豆,最近开发中收集的这篇文章主要介绍在linux下运行qiime,科学网—QIIME2在Linux环境下使用遇到的问题 - 肖斌的博文,觉得挺不错的,现在分享给大家,希望可以做个参考。

概述

1)qiime demux summarize --i-data demux.qza --o-visualization demux.qzv出现如下报错信息

53f4a656a76f59968ebddf4cfdfac996.png

解决方案2:由于个人是利用windows登陆服务器,为此下载Xming,在putty中对登陆节点进行localhost:0的设置

重新运行后,出现如下结果

b8e752b407b70e4b52cd88bc8f397387.png

此处注意,用解决方案1不能使用命令

qiime tools view demux.qzv

用解决方案2,用此命令查看数据时,出现一些报错信息,但不影响结果查看

cc9bf649951ccc83e8138f14324da9b7.png

2)qiime dada2 denoise-single --i-demultiplexed-seqs demux.qza --p-trim-left 0 --p-trunc-len 120 --o-representative-sequences rep-seqs-dada2.qza

最后

以上就是甜甜黄豆为你收集整理的在linux下运行qiime,科学网—QIIME2在Linux环境下使用遇到的问题 - 肖斌的博文的全部内容,希望文章能够帮你解决在linux下运行qiime,科学网—QIIME2在Linux环境下使用遇到的问题 - 肖斌的博文所遇到的程序开发问题。

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