Ubuntu 18.04.6 LTS (CPU版) 安装CCMpred

摘自：ubuntu18.04安装CCMpred_Gentlezzx的博客-CSDN博客

（1）首先从官网下载CCMpred安装包，添加环境变量

chenqiufen@cpuserver-14:~$ git clone --depth=50 --branch=master https://github.com/soedinglab/CCMpred.g                                                  it

chenqiufen@cpuserver-14:~$ cd CCMpred/

chenqiufen@cpuserver-14:~/CCMpred$ git checkout -qf 688e4ba1734bde553e7299ce058                                                                          b08fae49bb248

chenqiufen@cpuserver-14:~/CCMpred$ git submodule update --init --recursive

chenqiufen@cpuserver-14:~/CCMpred$ export CC=${CC:-gcc}

chenqiufen@cpuserver-14:~/CCMpred$ export CC_FOR_BUILD=${CC_FOR_BUILD:-gcc}

然后就行编译，安装，编译时需要禁用CUDA和多线程模块

查看一下cmake的版本 

chenqiufen@cpuserver-14:~/CCMpred$ cmake --version

# cmake version 3.10.2
# CMake suite maintained and supported by Kitware (kitware.com/cmake).

chenqiufen@cpuserver-14:~/CCMpred$ cmake -DWITH_CUDA=off -DWITH_OMP=off

chenqiufen@cpuserver-14:~/CCMpred$ make

然后需要把CCMpred/bin/目录下的文件：ccmpred复制到根目录下的/bin/，就可以在命令行调用ccmpred了。

sudo cp ./bin/ccmpred /bin/ccmpred

在命令行输入ccmpred测试：

chenqiufen@cpuserver-14:~/CCMpred$ ccmpred
# Usage: ccmpred [options] input.aln output.mat

 长截图如下

最后

以上就是畅快红酒为你收集整理的Ubuntu 18.04.6 LTS (CPU版) 安装CCMpred的全部内容，希望文章能够帮你解决Ubuntu 18.04.6 LTS (CPU版) 安装CCMpred所遇到的程序开发问题。

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