概述
生存分析研究的是某个事件发生之前过去的时间,在临床研究中最常见的应用就是死亡率的估计(预测患者的生存时间),不过生存分析也可以应用于其他领域如机械故障时间等。
在R中,survival包中有很多函数可以对生存数据进行建模,可以使用survfit()函数来估计删失数据的生存曲线,使用coxph()函数用来拟合Cox比例风险模型。
在survminer包中,可以使用plot()
函数、ggsurvplot()
函数用来绘制Kaplan-Meier生存曲线。
今天就来学习在R中使用ggsurvplot()函数绘制Kaplan-Meier生存曲线。
目 录
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1. 安装和加载R包
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2. 导入内置数据集
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3. 拟合生存曲线
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3.1 创建生存对象
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3.2 拟合曲线
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4. 绘制基础曲线
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5. 自定义曲线参数
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5.1 增加中位生存时间
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5.2 增加置信区间
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5.3 绘制累计风险曲线
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5.4 添加风险表
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5.5 添加总患者生存曲线
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5.6 自定义调色板
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6. 美化生存曲线
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7. survfit()函数
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8. ggsurvplot()函数
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8.1 主要参数
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8.2 图标题和坐标轴标签
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8.3 图例标题和位置
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8.4 坐标轴范围、刻度间距
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8.5 置信区间
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8.6 P值文本大小和位置
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8.7 删失点
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8.8 生存表
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8.9 生存图高度
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8.10 字体样式
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End
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最后
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