搭建CPU+GPU 集群

http://www.doserv.com/article/2012/0831/6188160.shtml

随着计算机科学技术突飞猛进的发展，计算物理已经成为物理学研究过程中与理论物理，实验物理同等重要的研究方向。计算物理经常需要对海量的数据进行复杂的计算，其对处理器的浮点运算能力、I/O 性能、内存容量以及带宽都要求较高。与此同时，呈数量级增长的数据对计算机硬件也提出了更大的挑战。无论是单台计算机还是超级计算机，因构架扩展的局限性或高额的经济成本，已无法满足科学计算的需求。计算机集群因其高速的运算性能、良好的兼容性及可扩展性，逐渐被科学计算领域所认同。中科院近代物理研究所一直以重离子

核物理基础研究和相关领域的交叉研究为主要学科方向，相应发展加速器物理及核技术。目前，中科院近物所超算中心已具有深腾7000G 超级计算集群一套，胖节点集群一套，专用工作站集群一套以及终端集群一套。其中深腾7000G 超级计算集群是CPU/GPU 混合集群，其余均是自建。

自建集群搭建

硬件搭建

中科院近代物理研究所超级计算中心自主搭建的CPU集群，共有22个节点及一个24 口千兆交换机。22个节点中一个作为管理节点，其余均为计算节点。每个计算节点配置如下：Intel Q6600CPU 处理器一个、2GB内存、160GB硬盘。管理节点装有两块。

网卡，一块连接对外以太网，一块连接集群节点间组成的局域网。连接方式如图1 所示。

软件安装集群所有节点(含管理节点)均安装RHEL5.6 操作系统，采用PXE +KickSTart的无人值守批量安装方式，这样除一个服务器节点外，其余节点无需光驱或者软驱。之后，大量的计算机采用网络安装Linux操作系统，不仅提高效率，而且节点相同的配置也利于以后集群系统的维护。PXE+KickSTart的安装需要DHCP和T F T P 服务， 将其配置于管理节点，KickSTart所生成的ks.cfg配置文件，存放在系统安装文件服务器Server上，安装节点主机需PXE 支持的网卡。

服务器依次配置IP地址、DHCP 服务、TFIT 服务及NFS 服务，之后配置ks.cfg 文件。ks.cfg 文件是待安装机器所有的配置文件，每台机器在安装Linux系统后都会自动生成ks.cfg，并记录系统安装时所做的每一步操作。然后配置共享的文件夹及PXE启动方式。保存后重启，安装自动完成。集群服务的配置管理节点一块网卡接外网，另一块接交换机，交换机用于连接计算节点所组成的局域网中的每个客户端。

每个计算节点的IP地址配置好后，安装SSH，并生成公钥和私钥，之后将.SSH 文件夹复制到集群其他节点上，验证是否所有节点之间可以SSH 无密码登录。在之前安装操作系统时用到了NFS 服务，NFS 是Network File System的简称，它的最大特点是可以通过网络让不同的机器彼此共享文件。在Client端扫描可以使用的Server 共享目录，之后建立挂载点，使用mount命令挂载远程共享目录，并验证所有节点是否已共享成功。

最后

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