隐形巨人

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2年10月24天

单细胞分析:聚类流程(六)

1. 学习目标描述质量控制步骤后scRNA-seq分析的工作流程(聚类)。现在有了高质量的细胞,可以继续工作流程。最终,希望对细胞进行聚类并识别不同的潜在细胞类型,但是在那之前需要完成几个步骤。下面的工作流程示意图中的绿色框对应于QC 后采取的步骤,共同构成了聚类工作流程。工作流程2. 聚类流程对于具有信息性的事物,它需要表现出变化,但并非所有变化都是信息性的。聚类分析的目的是保留数据集中应该定义的细胞类型的主要变异来源,同时消减由于无意义的变异来源(测序深度、细胞周期差异、线粒体表达、批次效应