典雅灰狼

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2年10月17天

sWGS检测CNV的一点探索ichorCNA笔记二、 QNDASeq笔记

ichorCNA笔记这个软件可以检测切除的肿瘤组织,识别其中的肿瘤细胞含量,也可以用来检测纯肿瘤组织。可以有参考,也可以不用,官方提供了参考,可以自建。1、 软件安装软件官网:https://github.com/broadinstitute/ichorCNAlibrary(devtools)install_github("broadinstitute/ichorCNA")2、软件使用# 1、准备数据,分块10Khmmcopy_utils/bin/readCounter --