淡然猫咪

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2年10月24天

linux可变剪切分析,SUPPA 可变剪切分析

SUPPA是一款通过转录本定量来获取可变剪切定量结果的软件。转录本的定量方式有很多,例如count,FPKM, TPM等,作者建议使用TPM,因为先均一化了基因的长度,然后均一化了测序的深度。同时建议使用salmon软件进行定量软件的下载与安装首先下载salmon二进制版本wget https://github.com/COMBINE-lab/salmon/releases/download/v0...