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2年10月18天

gwas snp 和_GWAS基因芯片数据预处理:质量控制(quality control)

一、数据为什么要做质量控制比起表观学研究,GWAS研究很少有引起偏差的来源,一般来说,一个人的基因型终其一生几乎不会改变的,因此很少存在同时影响表型又影响基因型的变异。但即便这样,我们在做GWAS时也要去除一些可能引起偏差的因素。这种因素主要有:群体结构、个体间存在血缘关系、技术性操作。二、怎么看数据是否需要进行质量控制下面分别为样本和SNP位点在数据中的直方图,当数据不在绝大多数的分布...