背后大炮

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2年10月17天

phyper函数计算的显著性到底是什么?

最近做项目遇到一个有趣的问题:有135个肺癌患者,已知这些患者的临床表征(性别、年龄、是否吸烟等),在计算中发现了EGFR基因在队列中显著突变,现在想知道某个临床表征(比如吸烟)对EGFR基因的突变有没有显著的影响?虽然已有文献证明了吸烟对于EGFR突变率和突变谱的影响,这里为了说明证明方法,还是以吸烟这个表征作为例子来举例说明。这个问题类似于抽样检查的问题:工厂生产了N个零件,其中有M个零件是次品,在一次抽样调查中随机抽取n个零件,其中有m个零件是次品,问这次的抽样检查是否合格?也就是..