要减肥翅膀

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单细胞分析:质控实操(五)

1. 学习目标构建质量控制指标并评估数据质量适当的应用过滤器去除低质量的细胞2. 过滤目标过滤数据以仅包含高质量的真实细胞,以便在对细胞进行聚类时更容易识别不同的细胞类型对一些不合格样品的数据进行检查,试图查询其不合格的原因3. 挑战从少量复杂的细胞中描绘出质量较差的细胞选择合适的过滤阈值,以便在不去除生物学相关细胞类型的情况下保留高质量的细胞4. 质量标准当数据加载到 Seurat 并创建初始对象时,会为计数矩阵中的每个单元组装一些基本元数据。要仔细查看此元数据,查看存储在 merge