TSNE降维分析及个性化作图
TSNE降维和UMAP一样，应用场景相似，具体的原理感兴趣的或者数据比较好的可以自行去学习。这里就不多说了，我们直接开始分析及作图吧。TSNE分析我们使用Rtsne这个包。首先加载R包：library(ggpubr)library(ggthemes)library(Rtsne)读入表达矩阵数据：setwd("F:/生物信息学/TSNE")A <- read.csv("tsne.csv",header = T,row.names = 1)TSN
