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2年10月20天

单细胞分析:PCA和归一化理论(七)

1. 学习目标讨论为什么归一化计数对于细胞之间的准确比较是必要的解释如何通过主成分分析 (PCA) 评估细胞之间的相似性在获得高质量单细胞后,scRNA-seq分析工作流程的下一步是执行聚类。聚类的目标是将不同的细胞类型分成独特的细胞簇。为了进行聚类,确定了细胞间表达差异最大的基因。然后,使用这些基因来确定哪些相关基因组是造成细胞间表达差异最大的原因。2. 计数归一化第一个是计数归一化,这对于准确比较细胞(或样本)之间的基因表达至关重要。除了许多其他因素之外,每个基因的映射读数计数与RNA的表达