单细胞分析:归一化和回归(八)
导读现在有了高质量的细胞,首先探索数据并确定任何不需要的变异来源。然后需要对数据进行归一化,计算方差并回归任何对数据有影响的协变量。1. 学习目标学会如何执行归一化,方差估计,鉴定易变基因2.Info目标准确归一化和缩放基因表达值,以解决测序深度和过度分散计数值的差异。识别最可能指示存在的不同细胞类型的变异基因。挑战检查并删除不需要的变异,这样就不用在下游对这些细胞进行聚类建议在执行聚类之前,对存在的细胞类型的期望有一个很好的了解。了解是否期望细胞类型复杂性较低或线粒体含量较