概述
编辑距离
编辑距离,又称Levenshtein距离(也叫做Edit Distance),是指两个字串之间,由一个转成另一个所需的最少编辑操作次数,如果它们的距离越大,说明它们越是不同。许可的编辑操作包括将一个字符替换成另一个字符,插入一个字符,删除一个字符。- 如果str1="ivan",str2="ivan",那么经过计算后等于 0。没有经过转换。相似度=1-0/Math.Max(str1.length,str2.length)=1
- 如果str1="ivan1",str2="ivan2",那么经过计算后等于1。str1的"1"转换"2",转换了一个字符,所以距离是1,相似度=1-1/Math.Max(str1.length,str2.length)=0.8
- str1或str2的长度为0返回另一个字符串的长度。 if(str1.length==0) return str2.length; if(str2.length==0) return str1.length;
- 初始化(n+1)*(m+1)的矩阵d,并让第一行和列的值从0开始增长。
- 扫描两字符串(n*m级的),如果:str1 == str2[j],用temp记录它,为0。否则temp记为1。然后在矩阵d[i,j]赋于d[i-1,j]+1 、d[i,j-1]+1、d[i-1,j-1]+temp三者的最小值。
- 扫描完后,返回矩阵的最后一个值d[n][m]即是它们的距离。
计算相似度公式:1-它们的距离/两个字符串长度的最大值。
| | i | v | a | n | 1 |
| 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 |
i | 1 | | | | | |
v | 2 | | | | | |
a | 3 | | | | | |
n | 4 | | | | | |
2 | 5 | | | | | |
2、i列值的产生 Matrix[i - 1, j] + 1 ; Matrix[i, j - 1] + 1 ; Matrix[i - 1, j - 1] + t
| | i | v | a | n | 1 |
| 0+t=0 | 1+1=2 | 2 | 3 | 4 | 5 |
i | 1+1=2 | 取三者最小值=0 | | | | |
v | 2 | 依次类推:1 | | | | |
a | 3 | 2 | | | | |
n | 4 | 3 | | | | |
2 | 5 | 4 | | | | |
| | i | v | a | n | 1 |
| 0 | 1 | 2 | | | |
i | 1 | 0 | 1 | | | |
v | 2 | 1 | 0 | | | |
a | 3 | 2 | 1 | | | |
n | 4 | 3 | 2 | | | |
2 | 5 | 4 | 3 | | |
| | i | v | a | n | 1 |
| 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 |
i | 1 | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 |
v | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 | 3 |
a | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 |
n | 4 | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 |
2 | 5 | 4 | 3 | 2 | 1 | 1 |
package com.sufa.java;
/**
* @className:MyLevenshtein.java
* @classDescription:Levenshtein Distance 算法实现
* 可以使用的地方:DNA分析 拼字检查 语音辨识 抄袭侦测
* @author:gsqing
* @createTime:2012-1-12
*/
public class MyLevenshtein {
public static void main(String[] args) {
//要比较的两个字符串
String str1 = "ACGTACGTTGCAACACGT";
String str2 = "ACGTACGTTCCAACACGT";
levenshtein(str1,str2);
}
public static void levenshtein(String str1,String str2) {
//计算两个字符串的长度。
int len1 = str1.length();
int len2 = str2.length();
//建立上面说的数组,比字符长度大一个空间
int[][] dif = new int[len1 + 1][len2 + 1];
//赋初值,步骤B。
for (int a = 0; a <= len1; a++) {
dif[a][0] = a;
}
for (int a = 0; a <= len2; a++) {
dif[0][a] = a;
}
//计算两个字符是否一样,计算左上的值
int temp;
for (int i = 1; i <= len1; i++) {
for (int j = 1; j <= len2; j++) {
if (str1.charAt(i - 1) == str2.charAt(j - 1)) {
temp = 0;
} else {
temp = 1;
}
//取三个值中最小的
dif[i][j] = min(dif[i - 1][j - 1] + temp, dif[i][j - 1] + 1,
dif[i - 1][j] + 1);
}
}
System.out.println("字符串""+str1+""与""+str2+""的比较");
//取数组右下角的值,同样不同位置代表不同字符串的比较
System.out.println("差异步骤:"+dif[len1][len2]);
//计算相似度
float similarity =1 - (float) dif[len1][len2] / Math.max(str1.length(), str2.length());
System.out.println("相似度:"+similarity);
}
//得到最小值
private static int min(int... is) {
int min = Integer.MAX_VALUE;
for (int i : is) {
if (min > i) {
min = i;
}
}
return min;
}
}
最后
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