概述
cuffdiff 输出文件(gene_exp.diff)中有的log2(FPKMy/FPKMx)值为inf或者-inf,有的test stat值为nan或-nan,他们的意思其实是来源于C语言。其中:
INF表示“无穷大”,是infinite的缩写。
NAN表示“无效数字”,是Not a number的缩写。
下面是C语言中INF和NAN的介绍
inf :infinity (linux) 等同于 #INF:infinity (windows)
nan :not a number 等同于 #IND:indeterminate (windows)
注意:
1、inf一般是因为得到的数值,超出浮点数的表示范围(溢出,即阶码部分超过其能表示的最大值);而nan一般是因为对浮点数进行了未定义的操作,如对-1开方。
2、nan==nan
结果是0或false,即不能和nan进行比较,和nan进行比较得到的结果总是false或0。所以可以用函数: int
isNumber(double d){return (d==d);}来判断d是否为nan,若d是nan则返回0,否则返回非零值。
3、1.0/0.0等于inf,-1.0/0.0等于-inf,0.0+inf=inf;
4、对负数开方sqrt(-1.0)、对负数求对数(log(-1.0))、0.0/0.0、0.0*inf、inf/inf、inf-inf这些操作都会得到nan。(0/0会产生操作异常;0.0/0.0不会产生操作异常,而是会得到nan)
5、得到inf时就查看是否有溢出或者除以0,得
最后
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