Ubuntu 16.04系统下CUDA8.0配置Caffe教程

由于最近安装了Ubuntu 16.04，本文教程的特点是不需要降级gcc的版本，毕竟cuda8.0已经支持gcc5以上(默认不支持，实际支持)。

本文是在参考caffe官网教程以及http://www.linuxidc.com/Linux/2015-07/120449.htm结合自己总结经验而来，对此表示感谢。

Ubuntu 14.04安装Nvidia CUDA7.5并搭建Python Theano深度学习开发环境http://www.linuxidc.com/Linux/2015-09/123562.htm

Ubuntu下CUDA（含GPU卡驱动）安装过程http://www.linuxidc.com/Linux/2015-07/120456.htm

Caffe + Ubuntu 14.04 64bit + CUDA 6.5 配置说明  http://www.linuxidc.com/Linux/2015-04/116444.htm

Ubuntu 14.04 安装配置CUDA  http://www.linuxidc.com/Linux/2014-10/107501.htm

Ubuntu 12.04配置NVIDIA CUDA5.5实录  http://www.linuxidc.com/Linux/2014-10/107502.htm

Ubuntu安装Theano+CUDA  http://www.linuxidc.com/Linux/2014-10/107503.htm

关于Ubuntu 12.04 下 CUDA5.5 的安装请参看如下链接 Ubuntu 12.04 安装 CUDA-5.5

Ubuntu 16.04系统下CUDA7.5配置Caffe教程 http://www.linuxidc.com/Linux/2016-07/132859.htm

1. 所需文件下载

1.1 Ubuntu16.04在官网下载，然后在windows下用UltraISO制作，相关文章搜索有一大片，此处不再赘述。 

1.2 cuda8.0下载，下载的版本是ubuntu15.04的run文件，个人感觉比较方便。 

1.3 cudnn5.1下载，进去之后如果有注册过nvidia的账户直接点击download，否则需要注册一个账户，注册完之后有一个调查，随便选几个钩就可以，然后下一步是接受条款开始就可以下载了。 

1.4 caffe下载就在官方的github下载就可以了 

2. 显卡驱动安装 

2.1 第一种方法是直接在ubuntu系统设置，软件和更新里面，选择中国的服务器源刷新之后，点击附加驱动选项，在Nvidia Corporation选择最新版本，然后点击应用更改，下载安装完之后重启。 

2.2 第二种方法是去官方下载好驱动的run文件，选择对应显卡型号下载。然后关机把显示器插到集成显卡接口上，或者终端下 

sudo gedit /etc/modprobe.d/blacklist.conf 

输入密码后在最后一行编辑上 

blacklist nouveau 

Ctrl +C保存后终端输入 

sudo update-initramfs -u 

重启之后在界面按Ctrl+Alt+F2，输入root以及密码，然后 

service lightdm stop 

sh 你自己的驱动文件的完整路径，默认选项就可以安装了，安装后重启

3. Cuda8.0安装 

3.1 以文件名为cuda.run为例，终端下输入 

sh cuda.run --override 启动安装程序，此处有大量的条款，一路空格到最后 输入accept，依次输入n(不安装显卡驱动)，然后一路y回车，有一个地方需要输入密码，还有两个地方确认安装路径，直接回车即可，完成安装，默认安装路径是/usr/local 

3.2 cudnn安装

将下载下来（注：请使用linux系统下载，不然会是其他文件， nvidia也是够了）的cudnn-5.1-linux-x64-v4.0-prod.tgz 解压之后，解压后的cuda文件夹先打开里面的include文件夹，空白右键在终端打开输入：

sudo cp cudnn.h /usr/local/cuda/include/ 

cd ~/cuda/lib64 

sudo cp lib* /usr/local/cuda/lib64/ 

继续更新文件链接

cd /usr/local/cuda/lib64/ 

sudo rm -rf libcudnn.so libcudnn.so.4 

sudo ln -s libcudnn.so.4.0.7 libcudnn.so.4 

sudo ln -s libcudnn.so.4 libcudnn.so 

然后设置环境变量 

sudo gedit /etc/profile 

在末尾加入 

PATH=/usr/local/cuda/bin:$PATH 

export PATH 

保存之后创建链接文件 

sudo vim /etc/ld.so.conf.d/cuda.conf 

键盘按a进入编辑状态，添加文字 

/usr/local/cuda/lib64 

然后按esc，输入:wq保存退出。 

终端下接着输入 

sudo ldconfig

使链接生效

4. 生成Cuda Sample测试 

首先在此之前先把需要的依赖包都安装好，为接下来make caffe做准备 （其中包括ATLAS 也可以选择装MKL或者OpenBLAS）

sudo apt-get install libprotobuf-dev libleveldb-dev libsnappy-dev libopencv-dev libhdf5-serial-dev protobuf-compiler 

sudo apt-get install --no-install-recommends libboost-all-dev 

sudo apt-get install libatlas-base-dev 

sudo apt-get install libgflags-dev libgoogle-glog-dev liblmdb-dev 

然后开始make samples ，终端下 

cd /home/gomee/NVIDIA_CUDA-7.5_Samples 

sudo make all -j4 

我是4核电脑所以用了j4，如果不是cudnn5.1正常情况下肯定会报错“unsupported GNU version! gcc versions later than 4.9 are not supported!”，原因就是这个cuda不支持gcc5.0以上，终端运行 

cd /usr/local/cuda-7.5/include 

cp host_config.h host_config.h.bak 

sudo gedit host_config.h 

Ctrl+F寻找有”4.9”的地方，应该是只有一处，在其上方的 

#if __GNUC__ > 4 || (__GNUC__ == 4 && __GNUC_MINOR__ > 9)将两个4改成5，保存退出，继续 

cd /home/gomee/NVIDIA_CUDA-7.5_Samples 

sudo make all -j4 

这就应该开始make了，此处大约有5、6分钟。完成之后 

cd /home/gomee/NVIDIA_CUDA-7.5_Samples/bin/x86_64/linux 

./deviceQuery 

最后会出现类似以下的信息 

CUDA Device Query (Runtime API) version (CUDART static linking) 

Compute Mode: 

< Default (multiple host threads can use ::cudaSetDevice() with device simultaneously) > 

deviceQuery, CUDA Driver = CUDART, CUDA Driver Version = 8.0, CUDA Runtime Version = 8.0, NumDevs = 1, Device0 = GeForce GTX 960

Result = PASS 

这就说明成功了。

5. Python配置 

将之前github下载的caffe压缩文件解压缩到任一目录，然后安装python 

python的版本安装有两种方式： 

第一是直接安装anaconda，去官网下载 ，选择linux 64bit 2.7版本下载安装，anaconda安装方便但是需要在最后的make配置文件中更改python包含路径。 

第二种方法就是使用原生的python2.7版本，终端下 

sudo apt-get install python-pip 安装pip 

这里我们用pip安装一些python需要的依赖包，不过为了避免各种问题，也可以通过apt-get安装

sudo apt-get install python-numpy python-scipy python-matplotlib ipython ipython-notebook python-pandas python-sympy python-nose 

以caffe默认解压到/home/user(你的用户名)/ ，文件夹名名称caffe为例 

cd /home/user/caffe/python 

sudo su 

for req in $(cat requirements.txt); do pip install $req; done 

这里用pip安装可能速度很慢，很可能下载好几个小时，推荐用清华大学的pip源临时安装，所以命令改为如下： 

for req in $(cat requirements.txt); do pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple $req; done 

这里如果第一次有很多红字错误，建议再运行几遍指导安装成功，对于黄字提示无需理会，可能是pip版本需要更新。

6. Caffe编译过程

接下来要进入最后的步骤了，终端中 

cd /home/user/caffe 

cp Makefile.config.example Makefile.config 

gedit Makefile.config 

将USE_CUDNN := 1 取消注释

INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include后面打上一个空格 然后添加/usr/include/hdf5/serial 如果没有这一句可能会报一个找不到hdf5.h的错误 

PYTHON_INCLUDE := /usr/include/python2.7  

　　/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include先不做更改。 

如果是需要生成matlab的caffe wrapper 请取消注释MATLAB_DIR然后替换为自己的目录 

说一下提前会出现的问题： 

第一，make过程中出现比如 string.h ‘memcy’ was not declared in this scope的错误是由于gcc编译器版本太新，解决方法是打开makefile搜索并替换 

NVCCFLAGS += -ccbin=$(CXX) -Xcompiler -fPIC $(COMMON_FLAGS) 为 NVCCFLAGS += -D_FORCE_INLINES -ccbin=$(CXX) -Xcompiler -fPIC $(COMMON_FLAGS) 保存退出 

第二，在make过程中还会报一个ld找不到libhdf5 和libhdf5_hl的链接问题，这个原因可能也是因为hdf5的问题，首先看/usr/lib/x86_64-linux-gnu 目录下有没有libhdf5.so和libhdf5_hl.so，如果有的话，查看属性是否有正确的链接(正常情况下应该是没有这两个文件)，然后右键在终端中打开 

sudo ln libhdf5_serial.so.10.1.0 libhdf5.so 

sudo ln libhdf5_serial_hl.so.10.0.2 libhdf5_hl.so 

注意，10.1.0和10.0.2可能不同电脑安装版本不同，注意看当前目录下存在的文件然后 

sudo ldconfig 生效 

如果没有的话

将# Whatever else you find you need goes here.下面的

INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include

LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib

修改为：

INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include /usr/include/hdf5/serial

LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib /usr/lib/x86_64-linux-gnu /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial

//这是因为ubuntu16.04的文件包含位置发生了变化，尤其是需要用到的hdf5的位置，所以需要更改这一路径

cd /usr/lib/x86_64-linux-gnu

\然后根据情况执行下面两句：

sudo ln -s libhdf5_serial.so.10.1.0 libhdf5.so

sudo ln -s libhdf5_serial_hl.so.10.0.2 libhdf5_hl.so

 

接下来就是直接编译的过程 

cd /home/user/caffe 

make all -j4 

make test -j4 

make runtest 

make pycaffe 

make matcaffe 

如果编译没报错正常的话，基本就没问题了。测试python打开 

cd /home/user/caffe/python 

python 

import caffe 

如果不报错就说明编译成功 

测试matlab打开./caffe/matlab/+caffe/private，看有没有生成一个caffe的mex文件，可以运行+test文件夹里面的程序测试。 

小问题： 

在使用python接口的时候，可能会报一个什么错误(我给忘记了–!)，对了是’Mean shape incompatible with input shape.’的错误，处理方法是python/caffe文件夹，编辑io.py文件，将 

if ms != self.inputs[in_][1:]: 

raise ValueError('Mean shape incompatible with input shape.') 

替换为 

if ms != self.inputs[in_][1:]: 

print(self.inputs[in_]) 

in_shape = self.inputs[in_][1:] 

m_min, m_max = mean.min(), mean.max() 

normal_mean = (mean - m_min) / (m_max - m_min) 

mean = resize_image(normal_mean.transpose((1,2,0)),in_shape[1:]).transpose((2,0,1)) * (m_max - m_min) + m_min

然后make clean再重新make

7. 总结 

　　至此，Ubuntu16.04下编译Caffe的教程就结束了