我是靠谱客的博主 殷勤导师,最近开发中收集的这篇文章主要介绍R中Error in gzfile(file, mode) : cannot open the connection“Permission denied”,觉得挺不错的,现在分享给大家,希望可以做个参考。

概述

前言:在R中rds文件进行保存。其中integrated为通过R处理过后的单细胞整合数据,将其保存在“integrated.s4.sct.rds”中。

执行后发现报错如下:

显示连接失败,无法打开此文件,可能原因是无权限。

解决办法:

  1. 首先尝试创建该文件,并想到自身账号在保存目录下是否拥有写入权限;
  2. 然后发现saveRDS属于base包中,尝试导入base包;
  3. 查阅资料后发现,可能需要加上绝对路径。

成功解决。

saveRDS(integrated,"/data1/Jiangss_/seuratdata/integrated.s4.sct.rds")


通过pdf()产生一个pdf文件,报错:显示无法打开该文件。

问题原因:

此时的data1文件所属者(A)不是我现在使用的用户(B),因此B无权限对A所属文件进行写入操作。

 解决办法:

  1. (法一)由于我用的mobaxterm软件,可以在左边的界面用鼠标直接右键进行创建。
  2. (法二)改写权限。通过root用户执行以下命令:
    sudo chown -R B$name:B$password data1
    

    对该文件更改权限。

顺利解决。

最后

以上就是殷勤导师为你收集整理的R中Error in gzfile(file, mode) : cannot open the connection“Permission denied”的全部内容,希望文章能够帮你解决R中Error in gzfile(file, mode) : cannot open the connection“Permission denied”所遇到的程序开发问题。

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