R in Docker

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我是靠谱客的博主默默蜜蜂，最近开发中收集的这篇文章主要介绍R in Docker，觉得挺不错的，现在分享给大家，希望可以做个参考。

概述

使用docker 搭建R运行环境，并打通R与Java的通道

Short Description

r docker image from ubuntu:16.04 (r-base, r-base-dev, devtools, open-jdk8, rJava)

Full Description

Docker images for R, Shiny... from Ubuntu

r-min
- Ubuntu:16.04
- r-base and r-base-dev
r-basic
- r-min
- devtools (with dependencies = T)
- (64 packages in site-library)
r-java
- r-basic
- open jdk 8
- rJava
r-shiny

第一步：拉取镜像

docker pull jaehyeon/r-java

第二步：运行容器

docker run -d -p 81:81 -ti docker.io/jaehyeon/r-java:latest /bin/bash

第三步：进入R，安装rJava和Rserver

install.packages('rJava')

install.packages('Reserve')

第四步：配置环境变量

#add R env
R_HOME=/usr/lib/R
PATH=$PATH:$R_HOME/bin
LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib/R/site-library/rJava/jri/
#add java
JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-8-openjdk-amd64
CLASSPATH=$JAVA_HOME/lib/
PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin:$R_HOME/bin
export
LD_LIBRARY_PATH R_HOME
JAVA_HOME CLASSPATH
PATH

参考网址：https://hub.docker.com/r/jaehyeon/r-java/