概述
生物技术。
DOI：
10.16660/j.cnki.1674-098X.2019.11.141
利用Python编程提取基因组基因序列
①
庞雪原 张婷婷
(东北农业大学生命科学学院 黑龙江哈尔滨 150036)
摘
要
：
当前分子细胞类中
小型实验室缺乏生物信息或编程背景研究员
，
无法对基因组进行大数据挖掘。
本文从生物信息
学角度将Python编程应用于生命科学领域，
利用循环遍历算法，
和Python特有的字典数据格式开发批量挖掘基因组上
基因序列和CDS序列的代码。
为生命科学研究提供便利。
最后将该代码实际应用于挖掘人类线粒体基因组上的全部基
因序列和CDS序列
，
并成功输出结果。
关键词：
生物信息学 Python编程 基因组 遍历算法 基因序列
中图分类号：
Q78
文献标识码：
A
文章编号：
1674-098X(2019)04(b)-0141-02
随着高通量测序的普及，
生物大数据挖掘已经成为当
前各个生命科学实验室必备技能。
对于当前国内生命科
学实验室存在的问题突出为各种中小型的分子生物学、
细
胞生物学实验室缺乏具备生物信息学或者编程背景的研
究人员。
因缺乏这类研究人员给实验室带来的不必要经
费支出与无用时间浪费的问题是不可忽视的。
例如实验室
想挖掘一个基因在基因组上具有多少个拷贝
最后
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