概述
Tensorflow数据读取有三种方式: 1)预加载数据; 2)产生数据,再把数据喂给后端; 3)从文件中直接读取
1、预加载数据(仅适用于数据量比较小的情况):
import tensorflow as tf
# 设计Graph
x1 = tf.constant([2, 3, 4])
x2 = tf.constant([4, 0, 1])
y = tf.add(x1, x2)
# 打开一个session --> 计算y
with tf.Session() as sess:
print sess.run(y)
2、产生数据,再把数据喂给后端(feed):
import tensorflow as tf
# 设计Graph
x1 = tf.placeholder(tf.int16)
x2 = tf.placeholder(tf.int16)
y = tf.add(x1, x2)
# 用Python产生数据
li1 = [2, 3, 4]
li2 = [4, 0, 1]
# 打开一个session --> 喂数据 --> 计算y
with tf.Session() as sess:
print sess.run(y, feed_dict={x1: li1, x2: li2})
说明:在这里x1, x2只是占位符,没有具体的值,那么运行的时候去哪取值呢?这时候就要用到sess.run()中的feed_dict参数,将Python产生的数据喂给后端,并计算y。这两种方案的缺点:
(1)预加载:将数据直接内嵌到Graph中,再把Graph传入Session中运行。当数据量比较大时,Graph的传输会遇到效率问题。
(2)用占位符替代数据,待运行的时候填充数据。
前两种方法很方便,但是遇到大型数据的时候就会很吃力,即使是Feeding,中间环节的增加也是不小的开销,比如数据类型转换等等。最优的方案就是在Graph定义好文件读取的方法,让TF自己去从文件中读取数据,并解码成可使用的样本集。
3、从文件中直接读取
首先,我们先创建数据流图,这个数据流图由一些流水线的阶段组成,阶段间用队列连接在一起。第一阶段将生成文件名,我们读取这些文件名并且把他们排到文件名队列中。第二阶段从文件中读取数据(使用Reader),产生样本,而且把样本放在一个样本队列中。根据你的设置,实际上也可以拷贝第二阶段的样本,使得他们相互独立,这样就可以从多个文件中并行读取。在第二阶段的最后是一个排队操作,就是入队到队列中去,在下一阶段出队。因为我们是要开始运行这些入队操作的线程,所以我们的训练循环会使得样本队列中的样本不断地出队。
在tf.train中要创建这些队列和执行入队操作,就要添加tf.train.QueueRunner到一个使用tf.train.add_queue_runner函数的数据流图中。每个QueueRunner负责一个阶段,处理那些需要在线程中运行的入队操作的列表。一旦数据流图构造成功,tf.train.start_queue_runners函数就会要求数据流图中每个QueueRunner去开始它的线程运行入队操作。
QueueRunner是一个不存在于代码中的东西,而是后台运作的一个概念,由tf.train函数添加。许多tf.train函数添加QueueRunner到你的数据流图中。在你运行任何训练步骤之前,需要调用tf.train.start_queue_runners函数,否则数据流图将一直挂起。tf.train.start_queue_runners 这个函数将会启动输入管道的线程,填充样本到队列中,以便出队操作可以从队列中拿到样本。
可以使用字符串张量(比如["file0", "file1"], [("file%d" % i) for i in range(2)], [("file%d" % i) for i in range(2)]) 或者tf.train.match_filenames_once 函数来产生文件名列表Filenames。将文件名列表交给tf.train.string_input_producer()函数,string_input_producer()来生成一个先入先出的队列FilenameQueue, 文件阅读器会需要它来读取数据。string_input_producer() 提供的可配置参数来设置文件名乱序和最大的训练迭代数, QueueRunner会为每次迭代(epoch)将所有的文件名加入文件名队列中, 如果shuffle=True的话, 会对文件名进行乱序处理。这一过程是比较均匀的,因此它可以产生均衡的文件名队列。这个QueueRunner的工作线程是独立于文件阅读器的线程, 因此乱序和将文件名推入到文件名队列这些过程不会阻塞文件阅读器运行。
tf.Coordinator和 tf.QueueRunner这两个类必须被一起使用。Coordinator类可以用来同时停止多个工作线程并且向那个在等待所有工作线程终止的程序报告异常。QueueRunner类用来协调多个工作线程同时将多个张量推入同一个队列中。
(1)文件准备:
$ echo -e "Alpha1,A1nAlpha2,A2nAlpha3,A3" > A.csv
$ echo -e "Bee1,B1nBee2,B2nBee3,B3" > B.csv
$ echo -e "Sea1,C1nSea2,C2nSea3,C3" > C.csv
$ cat A.csv
Alpha1,A1
Alpha2,A2
Alpha3,A3
(2)单个Reader,单个样本:
import tensorflow as tf
# 生成一个先入先出队列和一个QueueRunner
filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']
filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)
# 定义Reader
reader = tf.TextLineReader()
key, value = reader.read(filename_queue)
# 定义Decoder
example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']])
# 运行Graph
with tf.Session() as sess:
coord = tf.train.Coordinator()
#创建一个协调器,管理线程
threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)
#启动QueueRunner, 此时文件名队列已经进队。这个函数将会启动输入管道的线程,填充样本到队列中,以便出队操作可以从队列中拿到样本,在你运行任何训练步骤之前,需要调用tf.train.start_queue_runners函数,否则数据流图将一直挂起。
for i in range(10):
print example.eval()
#取样本的时候,一个Reader先从文件名队列中取出文件名,读出数据,Decoder解析后进入样本队列。
coord.request_stop()
coord.join(threads)
# output
Alpha1
Alpha2
Alpha3
Bee1
Bee2
Bee3
Sea1
Sea2
Sea3
Alpha1
(3)单个Reader,多个样本(tf.Session)
import tensorflow as tf
filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']
filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)
reader = tf.TextLineReader()
key, value = reader.read(filename_queue)
example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']])
# 使用tf.train.batch()会多加了一个样本队列和一个QueueRunner。Decoder解后数据会进入这个队列,再批量出队。
# 虽然这里只有一个Reader,但可以设置多线程,相应增加线程数会提高读取速度,但并不是线程越多越好。
example_batch, label_batch = tf.train.batch(
[example, label], batch_size=5)
with tf.Session() as sess:
coord = tf.train.Coordinator()
threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)
for i in range(10):
print example_batch.eval()
coord.request_stop()
coord.join(threads)
# output
# ['Alpha1' 'Alpha2' 'Alpha3' 'Bee1' 'Bee2']
# ['Bee3' 'Sea1' 'Sea2' 'Sea3' 'Alpha1']
# ['Alpha2' 'Alpha3' 'Bee1' 'Bee2' 'Bee3']
# ['Sea1' 'Sea2' 'Sea3' 'Alpha1' 'Alpha2']
# ['Alpha3' 'Bee1' 'Bee2' 'Bee3' 'Sea1']
# ['Sea2' 'Sea3' 'Alpha1' 'Alpha2' 'Alpha3']
# ['Bee1' 'Bee2' 'Bee3' 'Sea1' 'Sea2']
# ['Sea3' 'Alpha1' 'Alpha2' 'Alpha3' 'Bee1']
# ['Bee2' 'Bee3' 'Sea1' 'Sea2' 'Sea3']
# ['Alpha1' 'Alpha2' 'Alpha3' 'Bee1' 'Bee2']
(4)单个Reader,多个样本(tf.train.Supervisor.managed_session()),结果和上面相同
import tensorflow as tf
filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']
filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)
reader = tf.TextLineReader()
key, value = reader.read(filename_queue)
example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']])
# 使用tf.train.batch()会多加了一个样本队列和一个QueueRunner。Decoder解后数据会进入这个队列,再批量出队。
# 虽然这里只有一个Reader,但可以设置多线程,相应增加线程数会提高读取速度,但并不是线程越多越好。
example_batch, label_batch = tf.train.batch(
[example, label], batch_size=5)
sv = tf.train.Supervisor(logdir="E:/testdata/facades/hello")
with sv.managed_session() as sess:
for i in range(10):
print (sess.run(example_batch))
注:使用Supervisor时,tf.train.start_queue_runners()这个函数可以不用调用,由Supervisor帮我们自动处理。
参考:http://honggang.io/2016/08/19/tensorflow-data-reading/
https://blog.csdn.net/sunquan_ok/article/details/51832442
最后
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