Trinity组装学习
目前组装转录本遇到的挑战:1. 转录本表达高低差异大;2. Reads覆盖转录本不均匀;3. 测序错误;4. 相邻转录本组装时导致形成奇怪的转录本;5. 由于可变剪切所以要适应相应的不同转录本;6. 重复序列。 然后介绍了基于基因组的转录本组装方法Mapping-first(依赖于read比对的准确性,且大数据量reads导致判定错误)和直接组装方法Assembly-first,比