概述
我不知道为什么会这样。我的理解是用户至少有机会在执行默认操作之前使用-h。import os, sys, argparse
class argument_parser():
# call on all our file type parsers in the sequence_anlysis_method
def __init__(self):
self.db_directory = os.path.dirname(os.path.abspath(sys.argv[0]))
"""A customized argument parser that does a LOT of error checking"""
self.parser = argparse.ArgumentParser(
prog="igblast")
general = self.parser.add_argument_group(
title="nGeneral Settings")
general.add_argument(
"-x", '--executable',
default="/usr/bin/igblastn",
type=self._check_if_executable_exists,
help="The location of the executable, default is /usr/bin/igblastn")
self.args = self.parser.parse_args()
def _check_if_executable_exists(self,x_path):
if not os.path.exists(x_path):
msg = "path to executable {0} does not exist, use -h for helpn".format(x_path)
raise argparse.ArgumentTypeError(msg)
if not os.access(x_path, os.R_OK):
msg1 = "executable {0} does have not permission to runn".format(x_path)
raise argparse.ArgumentTypeError(msg1)
else:
return x_path
if __name__ == '__main__':
argument_class = argument_parser()
现在,如果/usr/bin/igblastn在那里,那么就可以了,但是如果不是的话,只要调用这个程序就会在selfu check_中引发异常,如果有可执行文件。
^{pr2}$
根据我的理解,用户总是有机会运行--help或-h,或者在采取任何导致此参数错误的操作之前。我对arg解析器的理解不清楚吗?
最后
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